Научная работа


NAUKA.jpg
Основные направления научной деятельности

В 2023 году в институте в рамках отраслевой программы Роспотребнадзора на 2021-2025 гг. «Научное обеспечение эпидемиологического надзора и санитарной охраны территории Российской Федерации. Создание новых технологий, средств и методов контроля и профилактики инфекционных и паразитарных болезней» и в соответствии с планом Координационного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации проведены исследования по 16 НИР, из них: 
- по проблеме «Эпидемиологический надзор за особо опасными инфекционными болезнями» - 8; 
- по проблеме «Диагностика, профилактика и лечение особо опасных инфекционных болезней» - 1; 
- по проблеме «Биомедицинские аспекты особо опасных и других инфекционных болезней» - 7.
 
Перспективные  направления научно-исследовательской работы

• Разработка комплексного алгоритма мониторинга возбудителей природно-очаговых инфекций и БОЧЖ: 
  -  молекулярное профилирование ПБА территорий; 
  - использование ДЗЗ из космоса, БПЛА и наземного эпизоотологического обследования природных очагов инфекций; 
  - применение ГИС-технологий второго поколения для контроля и оценки ситуаций в режиме реального времени («Zika-Map», «Z-Map»). 
• Разработка и внедрение новых экспресс-методов аллергодиагностики бруцеллеза и сибирской язвы in vitro. 
• Развитие технологий молекулярной идентификации патогенов. 
• Совершенствование методов прогнозирования развития эпидемиологических процессов (на примере COVID-19).
 
Основные научные достижения 2023 года:

....1. С применением научно-обоснованной модели мониторинга природного очага чумы на основе непараметрической последовательной статистической процедуры распознавания выполнены мероприятия по эпизоотологическому обследованию Центрально-Кавказского высокогорного природного очага чумы. Эпидемиологический риск заражения человека чумой определен как «низкий» (Отраслевая программа, п. 6.1.5).
....2. На основании масштабной систематизации современных данных завершена работа по созданию актуальных электронных баз данных стационарно неблагополучных по сибирской язве пунктов (СНП) и почвенных очагов (сибиреязвенных захоронений (СЯЗ), «моровых полей») для 89 субъектов РФ с указанием географических координат их расположения, содержащие сведения о 33 297 СНП, 3 898 почвенных очагах (совместно с ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора и ФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора). 
....3. На основе баз данных разработаны региональные кадастры сибиреязвенных СНП и почвенных очагов для ряда субъектов РФ с использованием геоинформационных систем (Отраслевая программа, п. 6.1). 
....4. Создана оптимальная модель ранжирования административных территорий субъектов РФ по степени потенциального риска осложнения эпизоотолого-эпидемиологической ситуации по сибирской язве на основе многофакторного анализа и ГИС (Отраслевая программа, п. 6.1). 
....5. Получены приоритетные данные о месте штаммов Bacillus anthracis, изолированных на территории Российской Федерации, в филогенетической структуре глобальной популяции возбудителя сибирской язвы. Существенно дополнена историческая модель глобального распространения возбудителя сибирской язвы, включая территорию Российской Федерации (Отраслевая программа, п. 6.5.26). 
....6. В рамках совершенствования системы геномного мониторинга зоонозных и природно-очаговых инфекций создана уникальная электронная база данных геномных последовательностей штаммов возбудителя сибирской язвы, включающая более 1100 геномов B. anthracis (из коллекции института отсеквенировано более 300 штаммов) (Отраслевая программа, п. 6.5.26). 
....7. Внедрена в работу Центра индикации методика прямого метагеномного анализа (для выявления атипичных штаммов, анализа сложных в диагностическом плане случаев), разработаны оригинальные протоколы работы с возбудителями природно-очаговых инфекций (Отраслевая программа, п. 6.1). 
....8. Сформирована коллекция штаммов вируса ККГЛ, принадлежащих к разным генетическим вариантам генетической линии Европа-1, циркулирующим в РФ, Республике Южная Осетия и Грузия (132 штамма), выполнена характеристика биологических свойств штаммов вируса (15 штаммов) (Отраслевая программа, п. 6.1). 
....9. Оптимизированы протоколы пробоподготовки образцов биологического материала для проведения таргетного метагеномного секвенирования последовательности гена 16s РНК бактерий и прямого метагеномного секвенирования образцов с целью детекции РНК-содержащих вирусов (протоколы апробированы при проведении метагеномного секвенирования образцов биологического материала с целью этиологической расшифровки случаев инфекционных заболеваний (Отраслевая программа, п. 6.1). 
....10. Проведено эпизоотологическое обследование территорий Херсонской и Запорожской областей, впервые методом ПЦР определена циркуляция вируса ККГЛ на территории Запорожской области. 
....11. Разработан эффективный протокол препаративного получения рекомбинантных антигенов бруцелл в E. coli с сохранением нативной структуры белков и чистотой более 98%. Получены субъединичные антигены бруцелл ribH1, FlgE, L7/L12, обладающие выраженной специфической активностью in vitro (активируют ex vivo праймированные Т-лимфоциты) (Отраслевая программа, п. 6.3). 
....12. Проведена оценка иммуноадъювантной активности CpG олигонуклеотидов с квадруплексными структурами по их способности стимулировать выработку медиаторов воспаления и иммунного ответа: интерферона-альфа и интерлейкина-1. Из 64 исследованных синтетических CpG олигонуклеотидов отобраны 8 - потенциально пригодных в качестве адъювантных компонентов вакцинных препаратов (Отраслевая программа, п. 6.3). 
....13. Проведены эпидемиологические расследования вспышек бруцеллёза в Республике Крым, Пензенской, Смоленской, Брянской областях и Республике Саха (Якутия). Исследовано более 1000 проб Выделены 16 культур бруцел. Проведён филогенетический анализ выделенных штаммов и реконструкция эпидемиологических связей очагов (Отраслевая программа, п. 6.1.13). 
....14. Разработаны и внедрены в практику: 
......1) «Набор реагентов для определения клеточного иммунитета к возбудителю бруцеллёза методом ИФА («БрИФ-тест»)» в образцах цельной крови (Отраслевая программа, п. 6.5.21). Проведены технические испытания медицинского изделия in vitro, акт № ВМ-07-23/23 от 07.08.2023. Срок окончания клинических испытаний – 2 квартал 2024 г. 
......2) «Набор реагентов диагностикум латексный бруцеллёзный антигенный сухой» («Лат-Бру-Аг-СтавНИПЧИ») (Отраслевая программа, п. 6.5.21). 
......3) «Набор реагентов диагностикум эритроцитарный туляремийный антигенный сухой» («ДЭТ-Аг») (Отраслевая программа, п. 6.5). 
......4) «Набор реагентов диагностикум эритроцитарный туляремийный иммуноглобулиновый сухой» («ДЭТ-Иг») (Отраслевая программа, п. 6.5).
 
По результатам проведенных научно-исследовательских работ подготовлено:  

Методические рекомендации (МР) 
Подготовлен проект: 
1. МР Методика применения беспилотных летательных аппаратов при эпизоотологическом обследовании природных очагов чумы. Письмо в ФС. Исх. от 29.08.2023 26-30-02/09-1786-2023 (федеральный уровень). 
Утверждены: 
1. МР 3.1.0322-23. Сбор учет и подготовка к лабораторному исследованию кровососущих членистоногих в природных очагах инфекционных болезней, утверждены 30.05.2022 (федеральный уровень). 
2. МР 3.1.3/3.5.2. Организация и проведение акарицидных обработок в природных очагах Крымской геморрагической лихорадки. Утверждены 25.04.2023 (федеральный уровень)

Информационно-методические письма: 
1. Информационно-аналитическое письмо «Эпидемиологическая ситуация по сибирской язве в мире в 2022 году и прогноз на 2023 год в Российской Федерации». Письмо Роспотребнадзора. Вх. от 06.03.2023 № 02/3440-2023-32. 
2. Информационно-аналитическое письмо «Анализ эпидемической и эпизоотической ситуации по бруцеллезу в мире в 2013-2022 годах и прогноз на 2023 год в Российской Федерации». Письмо Роспотребнадзора. Вх. от 06.03.2023 № 02/3435-2023-32. 
3. Информационно-аналитическое письмо «Информация об эпидемиологической ситуации по Крымской геморрагической лихорадке в Российской Федерации в 2022 г. и прогноз на 2023 г.». Письмо Роспотребнадзора. Вх. от 25.01.2023 № 02/1125-2023-32. 
4. Проект информационно-аналитического письма «Об итогах надзора за Крымской геморрагической лихорадкой в эпидсезон 2023 г. и о прогнозе эпидемической ситуации на 2024 г. в Российской Федерации». Письмо в Роспотребнадзор. Исх. от 17.11.2023 № 26-30-06/09-2376-2023 
5. Еженедельные информационно-аналитические справки «Анализ эпидситуации по COVID-19 на территории субъектов СКФО, Краснодарского края и Республики Адыгея». В течение года (еженедельно).

Информационный бюллетень 
1. Информационный бюллетень «Бруцеллез в Российской Федерации в 2022 г.». Письмо Руководителя Роспотребнадзора от 08.08.2023 №02/13340-2023-32
 
Аналитические обзоры: 
1. Эпидемиологическая обстановка по природно-очаговым инфекционным болезням в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах в 2022 г. (Аналитический обзор) /Авт.-сост. Куличенко А.Н., Малецкая О.В., Прислегина Д.А., Махова В.В., Таран Т.В., Василенко Н.Ф., Манин Е.А., Ашибоков У.М., Ульшина Д.В. – Ставрополь, 2023. – 104 с. 
2. Крымская геморрагическая лихорадка: эпидемиологическая и эпизоотологическая ситуация в Российской Федерации в 2022 г., прогноз заболеваемости на 2023 г. (Аналитический обзор) /Авт.-сост. Волынкина А.С., Ткаченко Н.О., Малецкая О.В., Скударева О.Н., Тищенко И.В., Жирова А.А., Лисицкая Я.В., Шапошникова Л.И., Ростовцева Д.В., Манин Е.А., Прислегина Д.А., Петровская В.В., Яцменко Е.В., Куличенко А.Н. Проблемы особо опасных инфекций. 2023;(2):6-12.   

Типовой проект: 
Типовой проект Комплексного плана мероприятий по профилактике бруцеллёза на территории субъекта Российской Федерации на 2023-2027 годы. Письмо Роспотребнадзора. Вх. от 10.05.2023 № 02/7426-2023-26   
 
Получено 2 патента РФ на изобретение, 2 свидетельства о государственной регистрации программы для ЭВМ. Рассмотрены и одобрены на заседании Ученого совета 9 проектов методических рекомендаций учрежденческого уровня внедрения.   
 
В 2023 году защитила диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук Кошкидько А.Г. - по специальности 1.5.6 Биотехнология   
 
По программам дополнительного профессионального образования на базе лаборатории подготовки специалистов прошли обучение 165 специалистов, из них по программам повышения квалификации подготовлено - 141 специалист, по программам профессиональной переподготовки - 24 специалиста.
 
В 2023 г. продлены на очередной четырехлетний срок полномочия «Сотрудничающего с ВОЗ справочного и научно-исследовательского центра по чуме». 
На базе института осуществляли свою деятельность: 
- референс-центр по мониторингу за возбудителем бруцеллеза; 
- референс-центр по мониторингу за возбудителем Крымской геморрагической лихорадки; 
- референс-центр по мониторингу за возбудителем сибирской язвы; 
- центр индикации возбудителей инфекционных болезней I-II групп патогенности и обеспечения противоэпидемической готовности (Ставропольский край, Республика Северная Осетия-Алания, Республика Ингушетия, Чеченская Республика); 
- научно-методический центр по мониторингу за возбудителями инфекционных и паразитарных болезней II-IV групп патогенности для субъектов Северо-Кавказского и Южного федеральных округов; 
- испытательный лабораторный центр; 
- специализированная противоэпидемическая бригада (СПЭБ); 
- научно-образовательный центр медико-биологических проблем (НОЦ МБП). 
Во исполнение приказа Роспотребнадзора от 27.06.2023 №410 с октября 2023 года Сочинское противочумное отделение ФКУЗ «Причерноморская противочумная станция» Роспотребнадзора переподчинено институту на правах филиала. 
В рамках научно-организационной работы института проведено 17 заседаний Ученого совета, 3 заседания проблемно-методической комиссии с рассмотрением вопросов планирования новых НИР и анализом результатов завершенных НИР и 24 заседания экспертной комиссии с экспертной оценкой материалов, предназначенных для опубликования в открытой печати. Работа совета молодых ученых была направлена на вовлечение молодых научных сотрудников и специалистов в научно-исследовательскую работу и участие в научных мероприятиях (конференциях, семинарах), повышение их профессиональной квалификации, в том числе с использованием возможностей научно-образовательного центра медико-биологических проблем.