Научная работа


__________________________________________

NAUKA.jpg Основные направления научной деятельности

Исследования проводятся в рамках отраслевой программы Роспотребнадзора на 2021-2025 гг. «Научное обеспечение эпидемиологического надзора и санитарной охраны территории Российской Федерации. Создание новых технологий, средств и методов контроля и профилактики инфекционных и паразитарных болезней» и в соответствии с планом Координационного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации.  
• Эпидемиологический надзор за возникновением, заносом и распространением опасных инфекционных болезней.
• Диагностика, профилактика и лечение особо опасных инфекционных болезней.
• Биомедицинские аспекты изучения особо опасных и других инфекционных болезней.
• Биологическая безопасность.
__________________________________________

Перспективные  направления научно-исследовательской работы

• Разработка комплексных алгоритмов мониторинга возбудителей природно-очаговых инфекций и БОЧЖ: 
   -  молекулярное профилирование ПБА территорий; 
   - использование ДЗЗ из космоса, БПЛА и наземного эпизоотологического обследования природных очагов инфекций; 
   - применение ГИС-технологий второго поколения для контроля и оценки ситуаций в режиме реального времени («Z-Map»);
   - мониторинг сибиреязвенных захоронений. 
• Разработка и внедрение новых методов диагностики о оценки состояния специфического иммунитета на основе тестов активации лейкоцитов. 
• Совершенствование средств специфической иммунопрофилактики. 
• Вопросы эпидемиологического надзора и прогнозирования при COVID-19. 
• Совершенствование препаратов для индикации и диагностики ООИ.
__________________________________________

Основные результаты научной деятельности в 2021 году

В отчетном году в институте в рамках отраслевой программы Роспотребнадзора на 2021-2025 гг. «Научное обеспечение эпидемиологического надзора и санитарной охраны территории Российской Федерации. Создание новых технологий, средств и методов контроля  и профилактики инфекционных и паразитарных болезней» и в соответствии с планом Координационного научного совета по санитарно-эпидемиологической охране территории Российской Федерации проведены исследования по 16 НИР и 1 НИР в рамках Распоряжения Правительства Российской Федерации от 12 октября 2019 г. № 2403-р.   

Основные результаты деятельности: 

• Научно-методическое обеспечение эпидемиологического надзора за новой коронавирусной инфекцией (COVID-19) 
...- обозначены особенности эпидемического процесса COVID-19 в регионах Северного Кавказа; 
...- систематизированы данные об особенностях применения мобильных подразделений СПЭБ Роспотребнадзора при решении поставленных задач в условиях пандемии COVID -19; 
...- разработан методический подход для количественной оценки состояния постинфекционного и поствакцинального клеточного иммунитета при COVID-19 путем определения антигенреактивности Т-лимфоцитов при исследовании капиллярной крови (CAST-INFy-CV).  
• Научно-методическое обеспечение эпидемиологического надзора за природно-очаговыми, зооантропонозными, особо опасными инфекциями. Санитарная охрана территории 

Инфекции, передающиеся клещами   
На территории региона Кавказских Минеральных Вод установлена циркуляция инвазивных боррелий, принадлежащих к OspC генотипам A4, G8 и вариантов генетически близких к генотипам A6 и A1, а также риккеттсий группы клещевых пятнистых лихорадок, в том числе, патогенных для человека: R. barbariae (7 образцов), R. raoultii (9), R. sibirica (2), R. aeschlimannii (1), R. helvetica (1). 

Особо опасные инфекции и зооантропонозные инфекции   
Геморрагическая лихорадка с почечным синдромом 
Уточнены ареалы распространения геновариантов ортохантовирусов на территории Черноморского побережья Краснодарского края и региона Кавказских Минеральных Вод – хантавирусов Тула, «Добрава-Сочи» и «Адлер».   

Чума Определены особенности формирования генетической линии возбудителя чумы 0.РЕ2 на территории природных очагов Кавказа и Закавказья на основе филогенетического анализа штаммов возбудителя чумы, выделенных на данной территории. 
Разработаны модель ранжирования территории Закавказского высокогорного и Приараксинского низкогорного природных очагов чумы по риску регистрации эпизоотий и предварительная MaxEnt модель ранжирования территории Прикаспийского песчаного природного очага чумы. Получены данные о современном пространственном распределении основных носителей микроба чумы (малых песчанок и малого суслика). 
Выявлено отсутствие пересечения ареалов горного и малого сусликов на территории Северного Кавказа и Предкавказья в результате моделирования на основе ретроспективных данных о встречаемости данных видов и климатических данных BioClim. 
Выявлен высокий уровень генетической дистанции между группами «высокогорных» и «горностепных» популяций горного суслика на основе данных генетического типирования С-региона мтДНК горного суслика. 
Разработана система внутривидового типирования возбудителя чумы на основе анализа гетерогенности белковых молекул штаммов Yersinia pestis методом MALDI-TOF MS. Создана база данных референсных масс-спектров штаммов Y. pestis основного, кавказского, алтайского подвидов и Y. pseudotuberculosis, характерных для территории Кавказа, Закавказья, Сибири и Монголии.   

Сибирская язва 
Разработана методика многофакторного анализа и проведено ранжирование административных территорий субъектов Российской Федерации по степени риска осложнения эпизоотолого-эпидемиологической ситуации по сибирской язве на основе многофакторного анализа с использованием ГИС, критериев, характеризующих стационарно неблагополучные по сибирской язве пункты. Результаты ранжирования административных территорий станут основой для формирования научно-обоснованных принципов планирования дифференцированных профилактических мероприятий на различных по риску осложнения ситуации территориях РФ. 
Определено филогенетическое положение 66 штаммов сибиреязвенного микроба в структуре глобальной популяции B. anthracis. Идентифицированы новые субкластеры B.Br.017 (EUROPE), B.Br.016 (SIBERIA) и B.Br.013 (ASIA) в кластерах генетической линии B.Br.002(B.Br.001/002). На основе матрицы генетических расстояний штаммов идентифицированы 96 маркерных SNP для 8 кластеров и субкластеров. 
Проведен эволюционно-филогенетический анализ популяции возбудителя сибирской язвы, который позволил определить время дивергенции основных генетических линий B. anthracis, включая линии, в которых представлены изоляты из Российской Федерации. Определены возможные пути эволюционно-географического распространения на территории России штаммов B. anthracis генетических линий A.Br.105(Tsiankovskii), A.Br118(STI), A.Br.014 (A.Br.Aust94) и B.Br.002. 
Разработан биоинформатический алгоритм для поиска в последовательностях генома B. anthracis вариабельных локусов, перспективных для генотипирования. Определены и отобраны для включения в схемы молекулярно-генетического типирования возбудителя сибирской язвы новые маркеры: 9 VNTR-, 6 Indel- и 6 SNP-локусов. Разработанные методики выявления вариабельности новых VNTR-, Indel-, SNP-локусов внедрены в практику Референс-центра по мониторингу за возбудителем сибирской язвы, способствуя совершенствованию системы генотипирования и субтипирования B. anthracis, с возможностью определения новых генетических вариантов для более тонкой дифференциации штаммов B. anthracis.   

Туляремия 
Разработан алгоритм детекции F. tularensis в полевом материале и объектах окружающей среды, основанный на технологии MALDI-TOF масс-спектрометрии с использованием селективных концентрирующих магноиммуносорбентов.   

Бруцеллёз 
Разработан способ иммунологической диагностики острого и хронического бруцеллёза, основанный на КАСТ и ИФА («БруцФероновый тест»). Способ можно использовать для количественной оценки активности специфического Т-клеточного иммунитета к возбудителю бруцеллёза (перед и после вакцинации). 
Разработан способ получения латексного диагностикума для выявления антител против возбудителя бруцеллёза (совершенствование иммуносерологических методов диагностики бруцеллёза). 
Предложена новая питательная среда для выделения бруцелл из биоматериала и объектов окружающей среды, контаминированных посторонней микрофлорой (разработана методическая документация) 
Предложен алгоритм идентификации и типирования штаммов бруцелл с использованием молекулярно-биологических методов. Подготовлен проект нормативно-методического документа федерального уровня внедрения. 
Впервые в структуре глобальной популяции Brucella abortus описана древнейшая генетическая ветвь, включающая штаммы из Азии. Предложена гипотеза о путях проникновения и дальнейшего распространения B. abortus на территории России. 
Проведён молекулярно-биологический анализ изолятов бруцелл на территориях юга европейской части России (112 штаммов в 2021 г.), который показал, что территории СКФО и ЮФО формируют единый, стойкий и длительно активный антропургический (сельскохозяйственный) эпизоотический очаг с циркуляцией преимущественно фенотипически и генетически однотипных штаммов бруцелл. 
Впервые описаны MLVA-генотипы штаммов B. melitensis, циркулирующих на неблагополучных по бруцеллезу территориях юга европейской части России.   

• Научно-методическое обеспечение диагностики инфекционных болезней. Регистрация иммунобиологических препаратов для диагностики инфекционных болезней: 
...- разработана биотехнология получения магноиммуносорбентов для селективного концентрирования спор Bacillus anthracis при проведении пробоподготовки образцов почвы с целью последующей детекции сибиреязвенного микроба. Разработана методика использования магноиммуносорбентов для селективного концентрирования спор B. anthracis; сформирован пакет нормативной (технической и эксплуатационной) документации на препарат «Магносорбенты для селективного концентрирования спор сибиреязвенного микроба «МИС-спора-СтавНИПЧИ»; 
...- разработана биотехнология получения сорбентов с магнитными свойствами для концентрирования возбудителей чумы и туляремии в объектах окружающей среды и полевом материале с последующей детекцией методом MALDI-TOF масс-спектрометрического анализа; 
...- сконструированы лиофилизированные наборы реагентов для диагностики туляремии и индикации ее возбудителя и разработана НД на: «Диагностикум эритроцитарный туляремийный антигенный сухой» («ДЭТ-Аг»); «Диагностикум эритроцитарный туляремийный иммуноглобулиновый сухой» («ДЭТ-Иг»); 
...- разработана биотехнология иммобилизации бруцеллезных антигенов на полимерном носителе для выявления антител против возбудителя бруцеллёза в реакции латекс-агглютинации; 
...- предложена новая питательная среда для выделения бруцелл из биоматериала и объектов окружающей среды, контаминированных посторонней микрофлорой, подлежащих исследованию на бруцеллез.
__________________________________________

По результатам проведенных научно-исследовательских работ подготовлено:  

Информационно-методические письма федерального уровня: 
1. Информационно-аналитическое письмо «Об эпидемиологической ситуации по сибирской язве в мире в 2020 году и прогнозе на 2021 год в Российской Федерации». Письмо ФС. Вх. от 02.03.2021 № 02/4030-2021-32. 
2. Информационно-аналитическое письмо «Об эпидемиологической ситуации по КГЛ в Российской Федерации в 2020 г. и прогнозе на 2021 г.». Письмо ФС. Вх. от 01.02.2021 № 02/1830-2021-32. 
3. Информационно-аналитическое письмо «Анализ эпидемической и эпизоотической ситуации по бруцеллёзу в мире в 2020 году и прогноз на 2021 год в Российской Федерации».  Письмо ФС. Вх. от 02.03.2021 № 02/4045-2021-32. 
4. Еженедельные информационно-аналитические справки «Анализ эпидситуации по COVID-19 на территории субъектов СКФО, Краснодарского края и Республики Адыгея».   

Рассмотрены и одобрены на заседании Ученого совета 2 проекта методических рекомендаций федерального уровня и 11 - учрежденческого уровня внедрения, 4 проекта нормативной документации.    

Направлены в установленном порядке: 
- информационный бюллетень «Бруцеллез в Российской Федерации в 2020 году» (исх. № 26-30-12/09-1095-2021 от 30.06.2021); 
- информационное письмо «Перечень диагностических препаратов, тест-систем, питательных сред, предназначенных для использования при проведении лабораторной диагностики бруцеллеза у людей» (исх. № 26-30-12/11-725-2021 от 14.05.2021).

Опубликовано: 176 научных работ, из них в журналах, индексируемых в WoS - 6, Scopus - 28, РИНЦ – 142, публикаций в материалах конференций – 103, аналитический обзор «Эпидемиологическая обстановка по природно-очаговым инфекционным болезням в Южном и Северо-Кавказском федеральных округах в 2020 г.».   

Получено: 12 патентов РФ на изобретение, зарегистрированы 4 электронные базы данных. Рассмотрены и одобрены на заседании Ученого совета 2 проекта методических рекомендаций федерального уровня и 11 - учрежденческого уровня внедрения, 4 проекта нормативной документации.    

В отчетный период 11 специалистов института приняли участие с устными докладами в 10 научно-практических конференциях, совещаниях и семинарах (регионального, федерального, российского и международного уровня).   

В 2021 году защитили диссертацию на соискание ученой степени кандидата биологических наук: 
- Гаркуша Ю.Ю. - по специальности 03.01.06 Биотехнология (в том числе бионанотехнологии); 
- Гостищева С.Е. - по специальности 03.01.06 Биотехнология (в том числе бионанотехнологии). 
По программам дополнительного профессионального образования (профессиональной переподготовки) подготовлено 31 специалистов, из них 10 – сотрудники института: 
1. «Бактериология». Основы безопасной работы с патогенными биологическими агентами (ПБА) I-II групп – 14 человек, из них 8 – сотрудники института 
2. «Эпидемиология». Основы безопасной работы с патогенными биологическими агентами (ПБА) I-II групп – 1, из них 1 – сотрудник института 
3. «Лабораторное дело». Особо опасные инфекции - 5, из них 1 – сотрудник института 
4. «Зоология. Особо опасные зоонозные инфекции» - 11 человек.   

По программам дополнительного профессионального образования (повышения квалификации) «Санитарная охрана территории. Организация и проведение эпидемиологического надзора за чумой» - подготовлено 35 человек – Республика Армения, г. Ереван. На основании распоряжения Правительства РФ от 06.03.2020 № 546-р и с целью профессиональной подготовки специалистов Республиканского центра карантинных и особо опасных инфекций Министерства здравоохранения Кыргызской Республики (далее - РЦК и ООИ МЗ КР) по программе первичной специализации «Зоология. Особо опасные зоонозные инфекции» - 4 человека.   

Указами Президента РФ от 05.03.2021 № 136, от 04.05.2021 № 267 Орденом Пирогова награждены 16 сотрудников института, медалью Луки Крымского - 12. 
__________________________________________
 
В рамках научно-организационной работы института проведено совещание руководителей противочумных станций, курируемых ФКУЗ Ставропольский противочумный институт Роспотребнадзора, по вопросам организации и проведения мониторинга за чумой и другими природно-очаговыми инфекциями и взаимодействия противочумных станций с институтом, органами и организациями Роспотребнадзора, 12 заседаний Ученого совета, 4 заседания проблемно-методической комиссии с рассмотрением вопросов планирования новых НИР и анализом результатов завершенных НИР и 23 заседания экспертной комиссии с экспертной оценкой материалов, предназначенных для опубликования в открытой печати.
__________________________________________